本廠針對垃圾處理過程中可能產生的污染物，均提供了良善的污染防制裝備，其中主要分成三大項：廢氣處理，廢水處理及臭味防治等等。
廢氣處理
為有效去除焚化垃圾所產生的酸性氣體及有害物質，本廠設置有旋風集塵器、半乾式洗煙塔、袋濾式集塵器等廢氣處理設備，進行多道處理程序，以確保排放氣體符合法規標準。
廢水處理
貯坑中的垃圾滲出水經收集後噴入爐內高溫焚化，以有效去除其中有機物及臭味。廠內的廢水採取有機與無機處理並行方式，處理後之回收水送入回收水槽，全部回收再利用，達成全廠廢水零排放的目標。
臭味防制
本廠垃圾貯坑採取負壓式的設計，貯坑內所生之臭味及沼氣經由一次風扇抽入焚化爐內燃燒，使臭味不會外溢至貯坑外，同時於傾卸平台上設置除臭系統，藉此消除垃圾車所產生的臭味。